根据毛泽东的指示，周恩来立即召集在京的中央政治局委员开会，通报林彪事件情况，作紧急战备部署，以应付突发事件。

　　周恩来告诉大家：请你们呆在这里，都不要离开新疆厅。

　　据当时在场的周恩来卫士高振普回忆说：“周总理走出新疆厅，对厅外的环境作了进一步的安排，指定专人看守厅门，无关人员不准进入，所有随领导们进来的人员，一律原地休息，谁也不准靠近新疆厅。”

　　人民大会堂西大厅内有一个北小厅，宽大的办公桌上摆着军用电话和各种电话，旁边还有一张小床。这里是周恩来常来办公和休息的地方。

　　在这里，经毛泽东批准，周恩来亲自下达了应对林彪事件的一系列紧急措施。

　　首先，周恩来下达了全国禁空令：关闭全国所有机场。没有周恩来、黄永胜、吴法宪、李作鹏等5人联合签发的命令，任何飞机不准起飞。

　　开动全部雷达监视天空，不许任何飞机飞进北京。

　　派陆军进驻空军、海军机场，与原守卫部队共管，严格遵守净空命令。

　　随后，周恩来拿起保密电话，亲自逐一给各大军区和各省市自治区的主要负责人打电话，通报林彪外逃情况。为了暂时保密，又能使对方听懂，周恩来既含蓄又清楚地说：“庐山会议第一次全体会议上第一个讲话的那个人，带着老婆儿子，坐飞机逃往蒙古人民共和国方向去了，你们要听从党中央、毛主席的指挥。从现在起，立即进入紧急备战。”

　　当时，有的大军区负责人一时还没听明白，还在电话中提问是谁跑了。周恩来着急地说：“你们还不懂吗？我再说一遍，……”

　　这一圈电话打下来，周恩来的嗓子都喊哑了。

　　13日凌晨3时15分，林彪的死党周宇驰、于新野、李伟信劫持一架直升机，从北京沙河机场强行起飞，他们携带大量文件，企图追随林彪逃往国外。坐镇在空军作战部的李德生及时把这一情况报告给周恩来。周恩来果断指示：“迫使它降落，不听就把它打下来，决不能让它飞出去。”空军随即派出了8架次战斗机拦截，但因为天黑没有及时找到这架直升机。

　　好在这架直升机的驾驶员陈修文是一位有高度政治觉悟、智勇双全的同志，在得知周宇驰他们的阴谋后，他千方百计地把飞机降落在怀柔县境内。落地时，他和周宇驰等人英勇搏斗，壮烈牺牲。周宇驰、于新野自杀身亡，李伟信被随即赶来的战士捕获。

　　北京是党中央所在地，是心脏，安全至关重要，一点纰漏都出不得。为了确保北京首都的安全和稳定，周恩来又把北京市、北京军区和北京卫戍区的主要负责人召集到人民大会堂，通报情况，并部署了几项应急措施？

　　一、要监视和搜索外逃被迫降的直升机，要人、机并获，将情况直接报告中央。

　　二、派卫戍区部队封闭控制北京郊区的几个机场，没有命令，任何飞机不准起飞。在没有接到允许飞机起飞的命令或通知时，发现有飞机起飞，要将其击落。

　　三、卫戍区要加强对新华社、广播电台、人民日报社等警卫目标的警卫工作，对中南海、人民大会堂等附近地区，要增派部队，加强警卫。

　　四、各部队进入一级战备，并部署北京地区防空降的作战任务。

　　根据周恩来的指示，为加强北京地区的战备力量，北京军区命令38军的3个机械化师、坦克一师、坦克六师和炮兵六师共6个师，归北京卫戍区统一指挥。这样，北京卫戍区的兵力就由原有的4个师增加到10个师。防御区域重点是北至南口，东到首都机场，南到河北保定以北。考虑到当时黄永胜、吴法宪、李作鹏、邱会作都是军委办事组的成员，是解放军各总部的负责人，为了确保北京卫戍区置于党中央的领导下，周恩来指示卫戍区部队对来自军委、各总部的电讯只收听，不汇报，即只接受来的电话、电报，不汇报卫戍区根据中央指示部署的应变