几个星期后，张太雷从日本回来了。他知道马林和陈独秀闹得很僵，便找了分管组织工作的张国焘。他说，李达和周佛海在信中，竟然要施存统不要理睬他。张国焘听后十分生气，立刻来到陈独秀家，质问在场的李达和周佛海。没想到，陈独秀承担了责任，并反问张国焘：“你的一些做法也很不恰当，例如，你为什么向马林提出劳动组合书记部的计划和预算，而且，对于工作人员还规定薪水，这是雇佣革命，你知道吗？中国党是独立自主的党，中国革命的一切都应有我们自己负责，所有党员都应无报酬地为党服务，你懂吗？”

　　张国焘不同意这种说法，带有征询的口吻说道：“共产国际代表是我们的顾问，我们不应该向他提供工作计划吗？党初建的活动，如果没有必要的经费，请问又能怎么进行呢？再说，很多专职党务工作者，没有最低的维系生活的薪水，难道让他们喝西北风不成？”

　　陈独秀虽然个性倔犟，但是，他有一点却是可贵的，那就是对待任何事情，只要是正确的意见，是决不会固执己见的。过了片刻，他以习惯性的动作，轻轻地拍着前额，不无歉意地说：“这样说来，那是得重新仔细考虑考虑。”

　　第二天，马林将张国焘找去，问起陈独秀避而不见的事情。马林似乎已经知道陈独秀和张国焘的争论，有意表扬了劳动组合部的工作，鼓励张国焘“担当起更大的责任”。

　　其实，马林多半说的是气话。不久，他与陈独秀会晤，便早已将此事置之脑后了。可是，马林的话对于张国焘来说，却如同几只作祟的虫子蓄积于胸，不时膨胀、涌动。不久，他便有宗派活动，以至在党内有“张国焘小组织”之说。他反对和排斥李汉俊、李达等人，说李汉俊“对资产阶级妥协，有改良主义的倾向”，李达是资产阶级的“研究派”。

　　这一切，陈独秀也多有耳闻。在一次会议上，蔡和森便反映，劳动组合书记部有意绕过中央，有独行其事的倾向。同样的问题，张太雷也有所反映。国共党内合作的问题，本是党内的机密，张国焘却把它捅到劳动组合书记部去了。

　　于是，马林认定张国焘有“小组织的问题”，并准备在党的会议上通过一个决议。张国焘急了，有事没事的找陈独秀讨说法，希望撤消所谓“小组织问题”的动议。陈独秀拗不过张国焘，在一次党的会议上，他特意提出：“党内没有什么小组织，要有，也只是有错误，以后不准再提什么小组织的问题。”于是，一场不大不小的党内风波，就此暂时平息。

　　1922年3月，张国焘从莫斯科回到上海。他高兴地告诉陈独秀，在远东各国共产党和革命团体代表大会上，他和国民党代表张秋白，受到列宁的单独接见。他还向陈独秀透露了这样的信息，列宁希望国共两党建立起合作联盟战线。

　　正是在这个问题上，陈独秀、张国焘与马林有着严重的分歧。马林主张加入国民党，实行党内合作，他们却坚持与国民党建立党外联合战线。由于他们一唱一和，所以，一直到中共二大，马林的党内合作的方式都没有为中国共产党所接受。

　　马林无可奈何，只得回到莫斯科，寻求共产国际的支持。8月，马林回到上海，立即建议中共中央召开特别会议，专门讨论党内合作问题。他在会上以不容置疑的口气，要求中共中央接受共产国际的决定，与国民党尽早实行党内合作。在共产国际的铁的纪律面前，陈独秀和张国焘表示服从国际的决定。

　　可是，陈独秀的心境总是忐忑不安，对与国民党的这种“捆绑夫妻”的关系，还是持怀疑态度。一次，在谈到在国民党中建立中共党团组织时，他不无担忧地对张国焘说：“中共如果遵照国民党的意见，取消在国民党